Proteiny

I když je měkká kontaktní čočka dobře ošetřována, je náchylná na průnik proteinů, které mohou denaturovat a působit na oko antigenně. Spolu se zvýšeným množstvím proteinů roste počet bakterií a může tak dojít k infekci.

Materiál kontaktní čočky se proto doporučuje zvolit takový, aby ukládal co nejméně depozit. Zároveň je vhodné, aby proteinová depozita byla fyziologicky kompatibilní s okem. Kontaktní čočky by se měly vyměňovat co nejčastěji, ideální jsou kontaktní čočky jednodenní. Jinou možností je výměna měkké kontaktní čočky za tvrdou.